En 1863, les travaux de creusement du canal Saint-Louis sont déclarés d'utilité publique (décret signé par Napoléon III), afin de développer le trafic maritime en aval de l'embouchure du Grand Rhône. Hippolyte Peut en est le promoteur. Le chantier est exécuté sous la direction de M. Pascal, ingénieur en chef du service spécial maritime des Bouches-du-Rhône, et MM. Bernard et Guérard, ingénieurs ordinaires des Ponts et Chaussées. Le canal est ouvert à la navigation en août 1871 ; il sera terminé le 28 septembre 1873 et inauguré en 1883, soit deux années après l'installation de la Compagnie générale de navigation. Il permet aux navires d'accéder directement de la mer aux eaux du Rhône, plus profondes, par le biais de l'écluse de Port-Saint-Louis (Référence : IA13004058). Le canal Saint-Louis est à l'époque un point nodal dans le trafic fluvio-maritime entre l'Europe et la Méditerranée : il permet d'éviter l'embouchure du Rhône. Le port de Fos, pouvant recevoir les navires qui venaient de la mer en direction du canal, complète le projet du canal. Mais l'activité, qui connaît son apogée dans les années 1960, subit un déclin, malgré la modernisation du complexe de Fos. En 1989, la municipalité transforme le bassin portuaire en port de plaisance (Référence : IA13004104). Le port de Port-Saint-Louis-du-Rhône est aujourd'hui rattaché au port de Marseille. Il accueille hydrocarbures, produits chimiques, bois et vins.