En 1648, Alexandre de Jassaud paie pour la fondation de la "lumière et exposition du saint Sacrement", il s'agit donc d'un fondation lié au maître-autel, le Saint-Sacrement ne pouvant être exposé sur un autel secondaire. On peut donc considérer que l'ensemble du maître-autel a été réalisé entre la reconstruction de l'église paroissiale, en 1588 (Référence IA04002351) et 1648, date de la fondation par le seigneur de Thorame-Basse.
Dans la visite pastorale de 1697, on trouve cette mention : "un tabernacle tout neuf, [de] deux statues une de st Pierre et une de st Paul très bien et neuves et de mesme que le tableau et le tout sur doré". Puis en 1712, "le maître-autel est en bon état, orné d'un retable doré avec deux colonnes mais dont la dorure commence à s'écailler. [...] à côté deux statues de saint Pierre et saint Paul, un tabernacle avec sa niche au dessus, bonne pierre d'autel, un chassis doré pour les devants d'autel".
Dans la visite de 1745, on trouve déjà mention d'une première modification : "le tableau et retable de l'autel de st Joseph du coté de l'épitre sont en bon état. On y a placé l'ancien tabernacle du maitre autel avec ses gradins qui sont encore bons". Ces éléments démontés du maître-autel pourraient être ceux conservés dans la sacristie.
Dans la visite de 1768 : "nous avons trouvé que le tombeau est cassé, la pierre sacrée sera donc changée. Le cadre et le devant d'autel d'un cuir doré sont en très bon état". Tout comme il l'était précisé dans la visite de 1712, le devant d'autel est alors un antependium : un cadre de bois permet de placer une toile peinte ou du cuir marouflé. La situation est similaire en 1785.
Au 19e siècle, des transformations ont été réalisées : un nouvel autel tombeau, en bois doré, a été placé ; les parties basses, sous les niches, ont visiblement été changées. L'exposition, actuellement conservée dans la sacristie, a peut-être été déposée à ce moment-là.
L'ensemble a été restauré en 2008.
