1. Epoque médiévale

La chapelle Saint-Jean est érigée au 13e siècle, après 1233, par les bénédictins de l'Ordre du Temple. Ces derniers réalisent alors de grands travaux à Comps-sur-Artuby, notamment la fortification de l'éperon rocheux qui accueillait le château de la commanderie et l'église paroissiale Saint-André (Référence du dossier : IA83003303). Bertrand de Comps, 17e Grand Maître de l'Ordre de 1244 à 1248, pourrait être à l'origine de cette construction. En effet, Comps était le siège d'une commanderie de Templiers puis d'Hospitaliers regroupant les commanderies de Saint-Maime, La Roque d'Esclapon, Lesperel, Draguignan, Roquebrune, Lesterel, Colmars, Beauvezer puis Brovès, vers 1728 et Bargemon, vers 1742. Les revenus de ce chef lieu de commanderie étaient relativement élevés. Le plan, le mode de construction et l'aménagement intérieur de la chapelle rappelle la chapelle Saint-Didier (Référence du dossier : IA83003299), légèrement antérieure. Autre similitude : des corbeaux en pierre, évoquant une structure en bois disparue : ici des hourds, selon Yann Codou, soutenant une galerie de bois, surplombant l'à-pic. L'existence d'un dépositoire accolé au mur sud n'est pas totalement à écarter en raison de vestiges en pierre à sa base et de la mention de quelques sépultures attestées à l'époque moderne.

2. Epoque moderne

Le vocable d'origine de la chapelle est Saint-Jean-Baptiste ainsi que mentionné notamment dans les visites de l'évêque et des commandeurs, presque systématiquement au cours de l'époque moderne. Le prieur est le commandeur de Comps et la chapelle, hormis mentions ponctuelles, est "honorablement tenue". Il s'agissait d'une chapelle "sans obligation de service" (1714) : deux grandes messes annuelles de fondation y avaient lieu, l'une à la Nativité de saint Jean Baptiste, l'autre le lendemain, pour le soulagement des âmes des commandeurs successifs (1723). La chapelle n'était toutefois pas dépourvue d'objets sacrés, parfois aux armes des commandeurs (exemples : tableau du baptême du Christ par Jean le Baptiste, aux armes du commandeur Badas ou reliquaire en argent également armorié, signalés lors de la visite de 1723). Ses reliques furent momentanément conservées dans l'église paroissiale, lors du défaut de fermeture de sa porte (visite pastorale du 17 mai 1682). En 1723, le vicaire de la paroissiale utilisait ses ornements que le commandeur a dû récupérer. En octobre 1777, le curé ouvre au commandeur les portes de la chapelle Saint-Jean qu'il dessert. Ces épisodes soulignent les interactions multiples entre le clergé séculier local et les réguliers, exclusifs seigneurs du lieu depuis 1540.

On apprend le 17 septembre 1641 que "les pénitents érigés dans la chapelle Saint-Jean appartenant à la commanderie jouissent de la chapelle Saint-Jean tant qu'il plaira au commandeur et à ses successeurs" (56 H 57). En 1685, une autre visite mentionne que ceux-ci y ont érigé une tribune, "du côté de la grande porte" (1714), avec "degrés à main droite en entrant" (1723), remise en état en 1773.

En 1705, le commandeur fait placer une porte double à l'entrée et des barres de fer aux fenêtres pour empêcher que personne ne puisse entrer. Il fait également réparer la "muraille du cousté du septentrion quelle estoit tombée, réparé les degrés de la tribune et fait faire une grande muraille de pierre sèche au près de l'entrée de la dite chapelle pour la commodité du public [le tout] pour 170 livres". Dans cette visite, celles de 1714, 1720 et 1723, il est fait mention d'une chapelle des pénitents distincte de la chapelle Saint-Jean, qui serait vraisemblablement localisée à l'emplacement de l'actuelle église Sainte-Philomène.

En 1714, il est fait mention d'un petit clocher "en forme de niche" qui aurait été, comme le toit, le mur de soutènement sud et les murailles qui entourent la chapelle, consolidé depuis peu.

En 1752, l'évocation du "tombeau des sieurs commandeurs", localisé près d'une porte refaite à neuf, explique la grande messe annuelle à leur intention. Les sieurs de Villevieille, habitants Jabron, se font enterrer dans le cimetière d'une chapelle Saint-Jean à Comps, d'après les registres paroissiaux des années 1679 et 1692. Malgré l'exiguïté de l'éperon rocheux, l'absence d'une chapelle Saint-Jean à Jabron autorise la supposition de quelques tombes avoisinant la chapelle Saint-Jean-Baptiste.

3. Epoque contemporaine

En 1845 et 1847, les élévations tant intérieures qu'extérieures, et le toit nécessitent des réparations.

Dans le courant des 20 et 21e siècles, les principales rénovations portent sur la toiture et l'élévation nord. En 1979, la toiture est restaurée. Un contrefort est renforcé et des tuiles sont posées sur les deux contreforts bâtis à la chaux. La maçonnerie du cul-de-four est rejointée à la chaux hydraulique (maître d'oeuvre : Jean-Claude-Ivan Yarmola, entreprise de maçonnerie SOTRAPUCO, R. Chiocchia et Fils). En 2009-2012, Louis-Martial Fahrner et la Société Méditerranéenne de Bâtiment et de Rénovation rénovent à nouveau le toit : les tuiles sont changées sur la nef mais le chevet est désormais couvert de lauzes. Le contrefort le plus à l'ouest est démoli et des injections de chaux sont réalisées dans le mur nord.