Le port de Saint-Tropez est construit à la fin du 15e siècle par les refondateurs de la ville et les marins génois venus habités le lieu à partir de 1470. Aux 15e et 16e siècles la navigation est au coeœur des activités de la ville par la pêche, le cabotage, la navigation au long cours ou l'activité de construction navale. Au milieu du 17e siècle, le port de Saint-Tropez est doté de deux quais bâtis sur l'eau, l'un partant de la tour du Portalet, couvert d'un mur défensif et prolongé par des enrochements ; le second quai part du sud de l'aglomération en direction de la tour Saint-Elme, elle aussi prolongée d'une petite digue en enrochements. Ce port privilégie l'accueil des bâtiments de guerre et de commerce. Les pêcheurs sont regroupés à l'extérieur du port dans une crique protégée par la Tour Vieille, le port abri de la Ponche (référence IA83002010). Les galères du Roi sont reléguées à la plage des Canebiers lorsqu'elles ne peuvent entrer dans le port. La tour Saint-Elme construite en 1637 protège l'entrée du port jusqu'à sa démolition en 1862. Elle est rebâtie à l'identique en 1991, légèrement plus au nord, pour accueillir la capitainerie du port. Du 17e au 19e siècle le quai sud-ouest (appelé môle du Ponant et aujourd'hui quai de l'épi) ne cesse de s'élargir pour accueillir les chantiers navals (référence IA83002007) dont l'activité est importante. Au cours du 18e siècle le port est l'objet de nombreux travaux d'entretien et d'aménagement. Entre le 18e et le 20e siècle plusieurs opérations de curage et creusement du port lui permettent de continuer à accueillir des navires. Les môles font aussi l'objet de plusieurs opérations d'aménagement. Le môle du Portalet est prolongé par une jetée en pierre à partir de 1715, l'opération se fait en plusieurs étapes jusqu'au milieu du 19e siècle. Entre 1819 et 1822 des travaux de construction et réparation des murs des quais sont entrepris. Au 18e siècle Saint-Tropez est le 3e port français de Méditerranée. La vie du port est active grâce au commerces de vin, de liège, de bois, l'installation de poissonneries, d'une fabrique de bouchons de lièges, une usine des câbles sous-marins aux Canebiers et une école d'hydrographie. Aux 19e et 20e siècles les travaux se poursuivent autour du port. Le môle du Portalet est prolongé vers l'ouest de 1846 à 1871, il devient la grande jetée (référence IA83002005). En 1905 le quai Suffren est élargi. Avant 1914, Saint-Tropez est le 17e port marchand de France. Les mines laissées par les allemands lors du débarquement des troupes alliées, le 15 août 1944, endommagent gravement le port, notamment la jetée du Portalet, la zone des chantiers navals et les quais, ainsi que la quasi-totalité de la ville. Entre 1945 et 1948 le port est reconstruit à l'identique. Entre 1955 et 1960 le môle des chantiers navals est agrandit avec des remblais en mer. En 1965 le bassin de plaisance baptisé Jean Lescudier (référence IA83002008) est construit à l'ouest du port de Saint-Tropez, qui est alors baptisé vieux-port. En 1967 la grande jetée (référence IA83002005) est prolongée de 212 m vers l'ouest pour agrandir le port. Deux appontements sont installés vers la cale de halage et quatre autres sont construits au sud du bassin. Au début des années 1970 le quai Bouchard est rectifié et forme un angle arrondi. En 1999-2000 le port fait l'objet d'une opération de réhabilitation et le phare rouge au bout de la grande jetée (référence IA83002005) est construit à l'identique du premier phare de Saint-Tropez.