Le mobilier de l'église a changé de disposition, notamment en ce qui concerne les autels et les tableaux. Au milieu du 19e siècle l'église compte quatre autels : le maître-autel et l'autel du Purgatoire en bois doré, l'autel de la Vierge et l'autel de Saint-Joseph. L'autel du Purgatoire est d'abord déplacé "de l'endroit le plus apparent de l'église", probablement dans la nef, à la chapelle Notre-Dame, tandis que l'autel de la Vierge le remplace. Puis en 1862, après l'inauguration d'un nouveau maître-autel en marbre, il reçoit une partie des restes de l'ancien maître-autel et pour cette raison est placé en face de la porte d'entrée. En 1906, l'autel du Purgatoire se trouve à droite du chœur et l'autel Saint-Joseph à gauche. Concernant les tableaux, cinq toiles se trouvent au fond du sanctuaire en 1851 : Sainte Cécile et saint Sébastien, copie neuve par le peintre briançonnais Eymard d'une toile trop vétuste ; la Décollation de saint Jean Baptiste et saint Jean Apôtre ; la Présentation au Temple de Jésus ; une Crucifixion, offerte en 1781 et une Descente de Croix. En 1928, un certain nombre d'ornements sont restaurés par les religieuses de la Providence de Gap. La chapelle de pénitents désaffectée accueille depuis quelques années un musée créé à l'initiative du parc naturel régional du Queyras. Les objets qui y sont présentés proviennent de l'ancienne chapelle de pénitents, de l'église paroissiale et des différentes chapelles de la commune de Ceillac.