Le port de la Lèque est un port de plaisance au sud de Port-de-Bouc. Implanté à l'entrée du canal de Caronte, à l’extrémité de la pointe de la Lèque, il fait face au port pétrolier de Lavéra et aux bassins ouest du GPMM. Le port de la Lèque possède un plan d'eau de 30 000m², il a une capacité d'accueil d'environ 270 bateaux de plaisance, il accueille aussi une quinzaine de bateaux de service du Grand Port Maritime de Marseille : remorquage, lamanage (opération d'amarrage des grands navires), avitaillement, bateaux de bathymétrie, etc.. Le bassin est protégé à l'ouest et au sud par la jetée de la Lèque (450 m de long en enrochement), aménagée d'une voie de circulation. A l'extrémité de cette jetée, est implanté le feu de signalisation de sortie du canal de Caronte, de type scintillant il est porté par une tourelle blanche métallique s'élevant à 14 m NGF, équipée d'une lanterne rouge. Cette jetée est prolongée par une jetée plus étroite, dite jetée nord-est, de 170 m de long, orientée nord-ouest/sud-est, encadrant la passe d'entrée du port. A son extrémité, un feu de signalisation d'entrée de port rouge, de type feu à éclats, installé sur une tourelle rectangulaire blanche maçonnée dont l'élévation est de 3 m NGF. Cette jetée constituée d'enrochement est doublée d'une voie de circulation est réservée aux services du port, l'amarrage des bateaux s'effectue directement au quai en béton. La troisième jetée, au nord-ouest, également orientée nord-ouest/sud-est, encadre l'entrée du port au nord et mesure 98 m de long. Le plan d'eau est divisé en deux parties selon leur utilisation. La partie sud et le long des jetées nord-ouest et sud sont dédiées aux plaisanciers, répartis sur trois appontements flottants en bois. La partie nord-ouest du bassin est composée de deux appontements de 35 m de long, un flottant et un fixe, en platelage bois, réservés aux bateaux de service du GPMM. La jetée nord-est est également réservée aux bateaux de service du GPMM.

La capitainerie du port de la Lèque est installée dans le Centre de Régulation Intégrée dit Tour Vigie des bassins ouest. Cette tour vigie regroupe les services maritimes nécessaires au fonctionnement du complexe portuaire du GPMM : administration, service portuaire de sureté / sécurité maritime et fluviale, service de bathymétrie, un bataillon de marin-pompiers, un peloton de surveillance maritime et portuaire (PSMP). Cette tour de 23 mètres permet une couverture optimale de l'espace maritime.