La fouille n'a pas permis de dater les vestiges aussi haut que ne l'indiquaient les textes qui font de cet édifice la 1ère église paroissiale d'Hyères, sous la juridiction de l'évêque de Toulon dès le 11e siècle. D'où un doute sur une identification avec l'édifice dont la 1ère phase de construction date du 13e siècle. En effet des fonds de cabanes retrouvés sur ce site ont été utilisés jusqu'au 13e siècle. Les principaux vestiges datent du milieu du 14e siècle. En 1765 l'église devint la chapelle des Pénitents Bleus qui quittèrent alors la tour Saint-Blaise. Dans les années 1920 le site fut la propriété de Mme Wromans-Leclerc qui fit aménager les ruines pour la visite et avait en projet d'y ériger un monument aux morts de la guerre de religions de 1596, dont l'inauguration devait se faire le 4 février 1923 en grande pompe.