Le port de plaisance de Jonquières est situé sur la rive sud de l'étang de Berre, au début du canal du Rhône à Marseille, entre le quai Sainte Anne et la digue du canal. Il occupe une surface d'environ 3,7 ha. Les bateaux sont répartis de part et d'autre de 9 appontements perpendiculaires au quai, dont certains sont en bois, d'autres en béton. La longueur des pontons varie de 45 m à 100 m de long. Les 2 appontements les plus à l'ouest sont protégés par des mini-digues en enrochement. Le port peut accueillir environ 400 bateaux essentiellement dédiés à la plaisance.