Le port de Cassis s'est développé au fond de la baie de Cassis sur un site de calanque. Au nord, les quais du port sont bordés par l'agglomération. Le bassin portuaire est délimité par deux môles en pierre et béton, désignés comme le vieux môle et le môle neuf. Le couronnement des quais est en pierre de Cassis, il intègre des escaliers en pierre à l'angle du quai des Baux. Les bornes d'amarrage sont de différentes factures : en pierre de Cassis, en canon retourné, en fonte de fer.

La structure de la jetée est en enrochements, couronnée par un parapet et un chemin de ronde en pierre. Son extrémité est balisée par un feu de signalisation d'entrée de port, porté par une tour cylindrique en pierre calcaire d'une dizaine de mètres de haut surmontée par un fanal métallique vert. Au nord de la passe d'entrée de port, orientée à l'ouest, se trouve un signal d'entrée de port rouge, une tourelle blanche d'environ huit mètres de haut surmontée d'un fanal rouge.

Le quai des Moulins au sud accueille la capitainerie, le chantier naval, l'’office de tourisme et une école de voile. La zone de carénage et une cale de mise à l’'eau sont accessibles à l'’angle du Vieux Môle et du quai Saint-Pierre à l’'est.

Parmi les équipements portuaire on peut noter : une grue de levage d’'une capacité de six tonnes, une cale de halage d’'une capacité de 15 tonnes, complétée de deux plans inclinés. Le quai Jean-Jacques Barthélémy accueille le Bureau de port. Ce port mixte accueille dix pêcheurs professionnels, quinze bateaux de promenade en mer et 375 bateaux de plaisance. Le port dispose d'une capacité d'environ 400 places et possède un plan d'eau d'environ trois ha pour 815 mètres linéaires de quai et 400 mètres linéaires d'appontements.