L'anse de Méjean est un port abri bien avant le 20e siècle. A l'origine, il n'y avait qu'un restaurant, monté sur pilotis, et trois cabanes en bois. Par temps de mistral, les pêcheurs venaient s'abriter là. Ils déposaient leurs filets et repartaient à pied en ville pour vendre leur poisson raconte Pierre Bonal, ancien élu de Toulon.
Les cabanes en bois qui longent l'anse sont détruites par les italiens en 1942, puis reconstruites après la guerre. Jusqu'en 1960, il n'y a pas d'électricité, les habitants s'éclairent à la lampe à pétrole. Ce n'est qu'en 1963, après le rachat du terrain à la Défense par la Société Civile Immobilière (SCI) des cabaniers que les premiers bâtiments en béton sont édifiés. En 2002, d'importants travaux de sécurisation sont effectués sur la paroi qui surplombe la mer. L'anse est fermée pendant plus d'un an pour la rénovation de cette section de littoral. L'ouverture de la grille d'accès a été accompagnée de celle du poste de secours et de la remise en place d'un périmètre réservé à la baignade. L'anse Méjean tire son nom de sa situation médiane entre la baie de la Garonne et la rade des Vignettes.
Prestataire extérieur du service mer pour l'opération de repérage du patrimoine des ports en 2015.